心衰+抑郁症（4+三区）
{摘要
背景：心力衰竭（HF）和抑郁症是常见的疾病，尽管越来越多的证据支持这两种疾病之间的密切联系，但其合并机制仍有待阐明。该研究进行生物信息学网络分析，以了解心力衰竭伴抑郁的潜在诊断生物标志物和治疗目标。
方法：从GEO数据库获取心力衰竭伴抑郁的队列转录组数据，并通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建共表达网络以确定关键模块。对心力衰竭伴抑郁相关模块中存在的共同基因进行GO和KEGG的通路富集分析。然后利用STRING数据库构建了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并筛选出网络中的枢纽基因。最后，从心力衰竭伴抑郁的其他数据集中验证了枢纽基因的表达差异。
结果：功能富集分析表明，血小板激活、趋化因子信号传导和病灶粘附在HF合并抑郁症中明显富集。PPI网络构建表明，心力衰竭伴抑郁可能与5个枢纽基因有关，包括STAT4、CD83、CX3CR1、COL1A2和SH2D1B。在验证的数据集中，STAT4和COL1A2在心力衰竭伴抑郁患者上调。
结论：STAT4和COL1A2可能是心力衰竭伴抑郁的生物标志物。相关通路可能为进一步心力衰竭伴抑郁的发病机理和治疗方法的研究提供依据。
图1心衰+抑郁症
间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征（2+三区）
{摘要
背景：间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的病因和治疗仍不明确。该研究的目的是确定与之相关的关键基因和特定调控通路，并通过综合生物信息学寻找潜在的药物活性成分。
方法：从GEO数据库获取GSE数据集。通过加权相关网络分析确定与间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征显著相关的模块。通过Cytoscape软件对关键模块中的基因进行功能富集和蛋白质相互作用分析，最后筛选出核心枢纽基因。此外，使用AutoDockVin软件，对活性成分和关键蛋白进行了分子对接验证。
结果：在WGCNA的14个模块中，绿松石模块与IC/BPS的相关性最高。该模块中的基因主要富集如细胞因子和细胞因子受体之间的相互作用和趋化因子信号通路等。将差异表达基因与相关模块中基因取交集，绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络，其中核心基因是上调基因CCR7和CCL19。在分子对接方面，传统抗炎药Tripterygiumwilfordii（雷公藤）的有效成分Triptolide（雷公藤甲素）能与上述两个核心基因有效结合。
结论：该研究确定了核心枢纽基因CCR7和CCL19，它们在间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中是重要的靶点。此外，CCR7和CCL19能与Triptolide（雷公藤甲素）有效结合，这将为开发治疗间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的新疗法提供新的依据。
图2间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征
都是上个月刚发的非肿瘤纯生信，简单易实现可以看到WGCNA与差异分析是常见的方法论感兴趣的同学可以来后台私信~END~预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇